金刚菩提灌顶是大灌顶之一，许多人认为金刚菩提灌顶以后，举行一下仪式就算完毕，不作圣因预言。金刚菩提灌顶重在于圣因预言，这个法绝对是大阿阇黎才能举行，普通阿阇黎法王们举行不了的。灌顶时，先将二百五十颗点有白点的菩提丸，和二百五十颗点有蓝点的金刚丸全部混在一起，成为五百粒一装，每一粒完全一样大小。有五百个受灌人，让他们每个人自己去摸取一颗丸，每个人自己摸的是菩提丸还是金刚丸他们自己是不知道的，因为有法器遮盖住，而且丸上的蓝、白点非常小，比头发尖大不了多少，不容易看清，更何况根本不准看，摸到一颗，手就直接在暗帐中装进法管封起来了，然后再拿出暗帐。而举行金刚菩提灌顶的这位大阿阇黎，要把菩提金刚种子给每个人种上，这个因缘种上后就永远不坏了，即便受灌人今后造诸恶业，堕落地狱，地狱恶报满了他一样能返回来接上这个法缘。那么怎么知道菩提金刚种子种上没有呢？不是那阿阇黎口说种上了就能相信的，真正的大阿阇黎此时会很谦虚，他不会说：“啊！行了，今天给你们种上菩提金刚不坏种子了，就算灌完顶了，快把供养给我就行了！”没有这回事的。而此时大阿阇黎他会说：“弟子们，现在我要给你们印缘起了，看缘起种上没有，我会把你们五百个人分成两队，分在这一边的是菩提丸，分在另一边的是金刚丸，但是你们现在不要打开法管看。”装著菩提金刚丸的法管是封住的，是弟子们自己摸取一颗丸装进去以后密封，不是大阿阇黎发给他们的。装丸之时，大阿阇黎距离装丸处至少三十米甚至上百米远。弟子们装丸后，经修法，大阿阇黎就点著名字说：某人坐右边，某人坐左边，某人坐左边，某人坐左边，某人坐右边……他会把所有的人分成两边排开，一边二百五十个，然后他要宣布某一边拿到的是菩提丸，某一边拿到的是金刚丸，这个时候一声法令下，打开法管看！所有人马上打开一看，全是大小一样无差别的红色丹丸，再非常仔细地查看，果然正如大阿阇黎所预言，坐在某一边的全部手中拿的都是有白点的菩提丸，另一边的人拿到的全部是有蓝点的金刚丸，这就叫圣因预言。因此，凡举行金刚菩提灌顶却没有圣因预言，而行人认这种无预言之灌顶师为金刚菩提灌顶大阿阇黎，这是错误知见，因为这是假的金刚菩提灌顶师，不是具真正大阿阇黎师资的人。